乳糖操纵子共3个结构基因，它们一起组成一个转录单位，即LacZAY，它们共用一个启动子PLAC。P是RNA聚合酶识别和结合的部位。在结构基因的上游还有个操纵基因O。Lac1通常位于启动子的上游，表达的蛋白质是通过蛋白质和DNA之间的相互作用来影响转录，称其为调节基因。P不是强启动子，因此要保持高水平转录，结构基因就需要一种专一的活化蛋白，称cAMP受体蛋白或分解代谢活化蛋白（CAP）.这样由P.O.CAP结合位点三部分构成了操纵子的调控区.
转录起始负调控：当乳糖不存在时，细胞内有活性的阻遏蛋白浓度超过诱导剂异构乳糖浓度时，提示LAC操纵子处于阻遏状态。这是因为调节基因LAC1表达的阻遏蛋白与操纵基因结合，阻断了RNA聚合酶通过操纵区的转录启动。当乳糖存在时，作为诱导剂的异构乳糖能与阻遏蛋白结合使具有阻遏活性的四聚体蛋白质转变为无活性的亚基单体，脱离操纵基因而发生转录（总的说来就是有时阻遏无时转录）。
CAP的正性调节：细菌中的CAMP与葡萄糖的分解代谢有关。当细菌利用葡萄糖分解提供能量时，它生成少而分解多，含量低；当无葡萄糖供应时，它含量增加，特异性的与CRP结合，CRP构象变化成CAP ，它能与特异的DNA序列结合，增强RNA酶的转录活性，可提高50多倍。综述：正调节和负调节根据存在的碳源性质及水平来协调操纵子的表达。当阻遏蛋白封闭转录时，CAP不能作用，但如果没有CAP的加强作用，即使阻遏蛋白解聚，转哈尔滨家教信息网录活性依然不高。
色氨酸操纵子的调www.hebjjw.com
由该操纵子调节基因TrpR所表达的蛋白质是一个无阻遏活性的二聚体蛋白，该蛋白受周围环境中色氨酸浓度的调节。当色氨酸浓度高时，无需更多表达色氨酸的酶，而色氨酸本身与无活性的阻遏蛋白结合，后者被激活，增加了对操纵基因O的亲和力，封闭操纵基因，色氨酸合成酶系表达被阻断。色氨酸浓度低时，尽管阻遏蛋白存在，但它缺乏色氨酸本身有效浓度的变构激活，此转录。
衰减子细调：转录衰减指转录可正常启动，但当转录进入第一结构基因之前立即停止转录的过程。在第一结构基因trpI即翻译起始部位上游开始有162个碱基组成的前导序列，作用就是减弱操纵子的转录作用。如前所述，色氨酸浓度未达到变构无活性阻遏蛋白时，但已经有点多时，先导序列就可以降低转录作用。
